Die einzigartige Gesamtanlage des Museumsquartiers befindet sich in der durch die UNESCO als Welterbe anerkannten Innenstadt Wismars und steht unter Denkmalschutz. Die Anlage beinhaltet einen Innen- und einen Außenhof, welche als Aufenthalts – und Eventfläche von dem Museum genutzt werden. Der Innenhof wird sowohl in den Bodenbelägen als auch in der großzügigen Treppenanlage vor dem Verbindungsneubau in Naturstein hergestellt. Diese kann als Bühne für Veranstaltungen genutzt werden.
Der Außenhof zeichnet sich durch eine zentrale Rasenfläche aus,  die von einem umlaufenden Weg gerahmt wird. Bänke, welche in die Vorpflanzung der Mauer eingeschrieben sind bieten Sitzplätze für Mitarbeiter und Besucher.  Ein vor Ort lagerndes Kunstrelief ergänzt den Garten im südwestlichen Teil dauerhaft.

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